Pertandingan dapat dilaksanakan pada Selasa atau Rabu daripada hari Kamis dengan memperhatikan terjadinya konflik penjadwalan.
Format
Pada babak gugur ini, masing-masing klub bermain secara kandang dan tandang, kecuali partai final yang dimainkan di tempat netral. Pengundian babak 32 dan 16 besar dilakukan pada 16 Desember 2011.[4] Pengundian untuk babak perempatfinal, semifinal dan final (untuk menentukan tim "tuan rumah") dilakukan pada 16 Maret 2012.[5] Kedua proses pengundian dipimpin oleh mantan pemain sepak bola asal Rumania, Miodrag Belodedici, yang ditunjuk UEFA sebagai duta final liga eropa 2012.
Setiap babak memainkan sepasang pertandingan kandang-tandang. Hasil dari kedua pertandingan akan dijumlahkan untuk menentukan hasilnya. Jika terjadi hasil imbang, maka ditentukan dari jumlah gol tandang, dimana klub yang mampu mencetak gol lebih banyak saat bermain di kandang lawan menjadi pemenangnya. Jika masih imbang, maka pertandingan kedua dilanjutkan dengan perpanjangan waktu, dalam dua babak masing-masing 15 menit. Jika kedua klub mencetak gol pada masa perpanjangan waktu sehingga hasilnya imbang, maka klub tandanglah yang menjadi pemenang. Jika tidak terjadi gol maka pemenang ditentukan dengan adu penalti.[6]
Pada pengundian babak 32 besar, dua belas juara grup dan empat peringkat tiga terbaik dari liga champions (berdasarkan hasil pertandingan di babak grup liga champion) menjadi unggulan sisanya non-unggulan. Klub unggulan diundi menghadapi klub non-unggulan, dimana klub unggulan menjadi tuan rumah pada pertandingan kedua. Klub dari grup yang sama maupun dari asosiasi yang sama tidak dipertemukan satu sama lain. Untuk pengundian babak 16 besar dan seterusnya pembatasan tersebut tidak dilakukan.
Peserta
Babak gugur ini diikuti oleh 32 klub. 24 klub lolos dari babak grup ditambah 8 klub peringkat tiga pada babak grup Liga Champions UEFA.
Peserta Liga Eropa
Grup
Juara grup (Unggulan pada babak 32 besar)
Juara kedua grup (Non-unggulan pada babak 32 besar)
