Les boires se gorgent d'eau lors des crues du fleuve ou des marées pour celles situées dans la basse-Loire. Certaines d'entre elles ont été comblées, mais lors des crues ou marées, des résurgences peuvent réapparaître après les comblements, notamment lorsque des fossés ont été aménagés lors des terrassements et aménagements fonciers.
Dans la Loire-Atlantique, la Boire Torse, située au Fresne-sur-Loire, en amont, et à Anetz pour son extrémité aval ; le Seil, qui est un bras-mort formant une boire située à Rezé ; à Nantes, l'île de Nantes était également parcourue de plusieurs boires, comblées, dont les plus connues étaient la Boire de Toussaint et la Boire des Récollets, encadrant l'ancienne île de Petite Biesse, située dans la partie centrale de l'île de Nantes.