Élève au lycée Henri-IV en Terminale C (scientifique), « elle connaît coup sur coup les honneurs du concours général de philosophie[4] puis la honte d'avoir été notée 1 sur 20 dans cette discipline au bac[5] », une incongruité qui fait d'elle une curiosité médiatique mais qui ne l'empêche pas d'obtenir son baccalauréat avec mention « Bien » en 1994[5].
Maîtresse de conférences en histoire de l'art contemporain à l'École normale supérieure de 2007 à 2019, chercheuse à l'Institut d'histoire moderne et contemporaine, elle publie plusieurs ouvrages et articles en histoire de l'art moderne et contemporain, dont une trilogie remarquée sur l'histoire mondiale des avant-gardes[13],[14],[15], et partage son expertise dans les médias[16]. Dans le même temps, elle se spécialise dans les humanités numériques appliquées à l'histoire de l'art[17], en créant notamment en 2009 le programme de recherche Artl@s, lauréat de l'Agence nationale de la Recherche en 2011[18].
Habilitée à diriger des recherches en 2015 à Sciences Po Paris, sous la direction de Laurence Bertrand Dorléac[19], elle est nommée en 2019 professeure titulaire de la nouvelle chaire en humanités numériques de l'Université de Genève[1], et devient également directrice du Centre d’Excellence Jean Monnet IMAGO destiné à la recherche et l’enseignement sur la mondialisation par l’image et cofinancé par le programme européen Erasmus +, l’École normale supérieure, et l'Université de Genève[20].
Béatrice Joyeux-Prunel, Luc Sigalo Santos et École normale supérieure, L'art et la mesure : histoire de l'art et méthodes quantitatives, Ed. rue d'Ulm, impr. 2010, cop. 2010 (ISBN978-2-7288-3653-6 et 2-7288-3653-1, OCLC690666515, lire en ligne)
↑Béatrice Joyeux-Prunel, Nul n’est prophète en son pays ? ’internationalisation de la peinture des avant-gardes parisiennes (1855-1914), Paris, Musée d’Orsay / Nicolas Chaudun, , 304 p..
↑Béatrice Joyeux-Prunel, Enjeux et méthodes pour une histoire mondiale des avant-gardes XIXe – XXe siècles, Sciences Po Paris, Habilitation à diriger des recherches, (lire en ligne)