La saison 2008-2009 du championnat de France de basket-ball de Nationale 1 est la 60e édition du championnat de France de basket-ball de Nationale masculine 1. La NM1 est le troisième plus haut niveau du championnat de France de basket-ball et le plus haut niveau amateur. Dix-huit clubs participent à la compétition.
À la fin de la saison régulière, les équipes classées 1re et 2de sont promues en Pro B.
Les équipes classées 15e à 18e de NM1 à l'issue de la saison régulière du championnat descendent en Nationale 2. Elles seront remplacées par les clubs vainqueurs des Séries NM2 à la condition, bien sûr, qu'elles satisfassent aux règles du contrôles de la gestion financière et aux conditions du cahier des charges imposé aux clubs de NM1. Sinon le 15e, voire les suivants, peuvent être repêchés si un ou plusieurs clubs de Nationale 2 ne remplissent pas ces conditions.
Le Centre fédéral est un club regroupant les joueurs appartenant à l'INSEP. Le club ne peut ni descendre ni monter d'un échelon. S'il se trouve dans une de ces positions, c'est le club suivant ou précédent qui sera sélectionné à sa place.