Une espèce biologique est dite endémique d'une zone géographique lorsqu'elle n'existe que dans cette zone à l'état spontané.

Cet article liste les espèces endémiques de France : départements métropolitains (dont la Corse), départements d'outre-mer (Guadeloupe, Martinique, Guyane et Réunion) et collectivités d'outre-mer à statut proche du statut départemental (Saint-Pierre-et-Miquelon, Mayotte, Saint-Martin et Saint-Barthélemy), mais n'inclut pas les anciens territoires d'outre-mer de Wallis-et-Futuna (collectivité territoriale), de la Polynésie française et de la Nouvelle-Calédonie (pays d'outre-mer) et des îles Éparses, de l'île de Clipperton et des Terres australes et antarctiques françaises (districts d'outre-mer).

Les espèces éteintes sont prises en considération si elles ont été observées vivantes après 1500.

• Enterographa brezhonega (Bretagne)

• Kudoa camarguensis Pampoulie, Marques, Rosecchi, Crivellia & Bouchereau, 1999

Découvert dans le delta du Rhône.

• Helicotylenchus minutus (Guadeloupe)
• Rotylenchus provincialis

• Trocheta falkneri, décrite en 1996

• Allobophora burgondiae
• Aporrectodea catalaunensis
• Dendrobaena provincialis
• Octodrilus juvyi (Massif de la Grande-Chartreuse) (décrit en 2005)

• Euproctus montanus (Corse)
• Salamandra corsica (Corse)

• Atelopus flavescens (Guyane française)
• Atelopus franciscus (Guyane française)
• Rhinella lescurei (= Bufo lescurei) (Guyane française)

• Colostethus chalcopis (espèce décrite en 1994 ; Martinique)

• Discoglosse corse (Discoglossus montalentii) (Corse)

• Scinax jolyi (espèce décrite en 2001 ; Guyane française)

• Eleutherodactylus barlagnei (Guadeloupe)
• Eleutherodactylus pinchoni (Guadeloupe)

• Microcaecilia unicolor (Guyane française)

• Sérotine de la Guadeloupe (Eptesicus guadeloupensis) (Guadeloupe)

• Megalomys desmarestii (Martinique ; éteint en 1902)

• Prolagus corsicanus (Corse ; éteint vers 1800)

• Gamisans (Jacques) et Marzocchi (Jean-François), La flore endémique de Corse, Edisud, 1996
• Gasc (Jean-Pierre) et al., Atlas of Amphibians and Reptiles in Europe, Societas Europaea Herpetologica / Muséum national d'Histoire naturelle, Paris, 1997
• Jeannel (René), Les fossiles vivants des cavernes, Gallimard, 1943

• Inventaire national du patrimoine naturel (INPN=
• Espèces endémiques à la Corse

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