Martin Mystère est un jeune adolescent de 16 ans, employé en tant qu'agent spécial au « Centre », une organisation secrète spécialisée dans les phénomènes paranormaux dirigé par M.O.M[1]. Souvent dragueur lors des missions qui lui sont attribuées, il enquête, en compagnie de sa demi-sœur Diana Lombard, de Java des Cavernes et avec l'aide, aussi, de sa montre-gadget Chrono-Scan, dans des endroits très étranges, mystérieux et effrayants où se trouvent des créatures inimaginables[2].
Martin Mystère est une adaptation très libre de la bande dessinée homonyme d'Alfredo Castelli et Giancarlo Alessandrini. Elle ne retient que les trois personnages principaux, qui sont largement modifiés pour les placer dans un environnement complètement différent, sans aucun rapport avec le matériel d'origine dont les histoires sont basées sur des faits réels. Le graphisme et l'animation sont clairement influencés par la japanime, et sont dans le même style graphique que Totally Spies! (également réalisé par Stéphane Berry[5]). Le design des personnages a été mis au point par Stéphane Berry[5] et leurs réalisations confiées à l'animateur Eddie Mehong.
En , Ubisoft annonce avoir signé avec la société de développement vidéoludique OUAT Entertainment pour un projet inspiré de la série et intitulé Martin Mystère : L'Attaque des Monstres[6]. Le , Martin Mystère : L'Attaque des Monstres est commercialisé en France sur console portable Nintendo DS[7].