Op de Pan-Pacifische kampioenschappen zwemmen 2014 in Gold Coast sleepte de Amerikaanse de bronzen medaille in de wacht op de 100 meter vrije slag, op de 50 meter vrije slag eindigde ze op de vierde plaats. Op de 4x100 meter vrije slag legde ze samen met Missy Franklin, Abbey Weitzeil en Shannon Vreeland beslag op de zilveren medaille. Samen met Missy Franklin, Jessica Hardy en Kendyl Stewart behaalde ze de zilveren medaille op de 4x100 meter wisselslag.
In Kazan nam Manuel deel aan de wereldkampioenschappen zwemmen 2015. Op dit toernooi eindigde ze als zesde op de 100 meter vrije slag en als achtste op de 50 meter vrije slag. Op de 4x100 meter vrije slag veroverde ze samen met Missy Franklin, Margo Geer en Lia Neal de bronzen medaille. Samen met Missy Franklin, Jessica Hardy en Kendyl Stewart eindigde ze als vierde op de 4x100 meter wisselslag. Op de gemengde 4x100 meter vrije slag werd ze samen met Ryan Lochte, Nathan Adrian en Missy Franklin wereldkampioen.
Tijdens de Olympische Zomerspelen van 2016 in Rio de Janeiro werd de Amerikaanse, ex aequo met de CanadesePenelope Oleksiak, olympisch kampioene op de 100 meter vrije slag, op de 50 meter vrije slag legde ze beslag op de zilveren medaille. Samen met Kathleen Baker, Lilly King en Dana Vollmer sleepte ze de gouden medaille in de wacht op de 4x100 meter wisselslag. Op de 4x100 meter vrije slag behaalde ze samen met Abbey Weitzeil, Dana Vollmer en Katie Ledecky de zilveren medaille.
