В первую (неофициальную) Красную книгу Карелии, вышедшую в 1985 году, были включены сведения о 160 видах сосудистых растений, 22 — грибов, 36 — позвоночных (9 — млекопитающих, 21 — птиц, 2 — земноводных, 4 — пресмыкающихся) и 31 — насекомых[1].
В 1995 году вышло первое издание Красной книги, подготовленное Министерством экологии и природных ресурсов Республики Карелия совместно с Карельским научным центром РАН и Петрозаводским государственным университетом[2]. Первое издание включало 755 таксонов: 390 видов и подвидов растений (в том числе 205 — сосудистых растений, 86 — мхов, 76 — лишайников и 24 вида грибов), а также 365 видов животных (из них млекопитающих — 26, птиц — 47, пресмыкающихся — 3, земноводных — 2, насекомых — 255, моллюсков и высших ракообразных — 4).
В 2007 году вышло второе издание Красной книги тиражом 2500 экземпляров в новой, изменённой и дополненной редакции. Перечень объектов растительного и животного мира, занесённых в это издание, был утверждён приказом Министерства сельского, рыбного хозяйства и экологии Республики Карелия, чего не было сделано в издании 1995 года. Теперь Красная книга Республики Карелия обрела официальный статус. В неё включены новые группы организмов, отсутствовавшие в первом издании, — это печёночные мхи и древесиноразрушающие (афиллофоровые) грибы[2]. Второе издание включало 881 таксон: 199 — сосудистых растений, 142 — мохообразных, 109 — лишайников, 61 — грибов, 23 — млекопитающих, 51 — рыб, 2 — пресмыкающихся, 1 — земноводных, 17 — рыб, 172 — насекомых, 2 — моллюсков и 2 — ракообразных[3].
В конце 2016 года перечень видов был обновлён: у части изменена категория статуса, исключены 76 объектов растительного и 35 объектов животного мира[4].
В 2020 году вышло третье, исправленное и дополненное издание Красной книги тиражом 1000 экземпляров. В отличие от предыдущего издания, в него включён Список объектов животного и растительного мира, нуждающихся в особом внимании (мониторинге)[5]. С 2020 года в перечнях редких и находящихся под угрозой исчезновения объектов растительного и животного мира на территории Республики Карелия внесено 774 объекта растительного и животного мира (к нуждающимся в особом внимании отнесены 143 таксона)[6], но третье издание включает описания только 310 таксонов (около 40 %) — это единственная Красная книга субъекта России, в которой описаны не все охраняемые таксоны.
↑Красная книга Карелии : Редкие и нуждающиеся в охране растения и животные / науч. ред. А. Д. Волков, Н. В. Лапшин. — Петрозаводск : Карелия, 1985. — 184 с. — 15 000 экз.
↑ 12Ивантер Э. В., Кузнецов О. Л.Предисловие // Труды Карельского научного центра РАН. — 2009. — № 1. — С. 5—6. — (Биогеография ; вып. 8 «Материалы по ведению Красной книги Республики Карелия»). — ISSN1997-3217.
↑ 12Приказ Министерства сельского, рыбного хозяйства и экологии Республики Карелия от 29 ноября 2007 года № 335 «Об утверждении Перечня объектов растительного и животного мира, занесённых в Красную книгу Республики Карелия» // Собрание законодательства Республики Карелия. — 2007. — № 12. — Cт. 1684.
↑Приказ Министерства по природопользованию и экологии Республики Карелия от 30 декабря 2016 года № 2488 «О внесении изменений в приказ Министерства сельского, рыбного хозяйства и экологии Республики Карелия от 29 ноября 2007 года № 335» // Собрание законодательства Республики Карелия. — 2017. — № 4. — Cт. 783.
↑Кузнецов О. Л., Артемьев А. В., Павлов А. Н. Предисловие // Красная книга Республики Карелия / гл. ред. О. Л. Кузнецов. — [3-е изд.]. — Белгород : Константа, 2020. — С. 4—9. — 448 с. — 1000 экз. — ISBN 978-5-907380-16-5.
Красная книга Карелии = Red data book of Karelia / науч. ред. Э. В. Ивантер, О. Л. Кузнецов. — Петрозаводск : Карелия, 1995. — 286 с. — 5000 экз. — ISBN 5-7545-0688-0.
Красная книга Республики Карелия = Red Data Book of Republic Karelia / науч. ред. Э. В. Ивантер, О. Л. Кузнецов. — [2-е изд.]. — Петрозаводск : Карелия, 2007. — 364 с. — 2500 экз. — ISBN 978-5-7545-1545-1.
Красная книга Республики Карелия / гл. ред. О. Л. Кузнецов. — [3-е изд.]. — Белгород : Константа, 2020. — 448 с. — 1000 экз. — ISBN 978-5-907380-16-5.