Йонида Маличи начала свою певческую карьеру на Festivali i Këngës, когда ей исполнилось 13 лет, с песней «Planeti i fëmijëve», в дуэте с Александом Рапи. В 1997 году она вернулась на Фестиваль в составе другого дуэта вместе с «Kastriot Tusha». Песня была посвящена Матери Терезе.
Сольная карьера Йониды Маличи началась в 1999 году, а её песня «Do jetoj pa ty» завоевала второе место на фестивале.
Маличи известна и тем, что изображает Джульетту в албанской музыкальной версии Ромео и Джульетты вместе с Албаном Скендерай.
Она провела четвёртый сезон «Танцы со звездами Албании», а также выступила судьей пятого сезона «Голоса Албании» в 2016 году.
В 2019 году представила Албанию на конкурсе "Евровидение-2019" с песней "Ktheju tokës", где заняла 17 место в финале с 90 баллами