Janet Maureen Thornton (née le ) est une scientifique britannique, directrice émérite de l'Institut européen de bio-informatique (EBI), qui fait partie du Laboratoire européen de biologie moléculaire (EMBL)[1],[2]. Elle est l'une des plus grandes chercheuses en Bio-informatique structurale, utilisant des méthodes informatiques pour comprendre la structure et la fonction des protéines[3],[4],[5]. Elle est directrice de l'EBI d'octobre 2001 à juin 2015 et joue un rôle clé dans ELIXIR[6].
Éducation
Janet Thornton fréquente la Bury Grammar School jusqu'en 1967, où elle est préfète en chef[7]. Après avoir obtenu son diplôme en physique à l'Université de Nottingham, Thornton obtient une maîtrise en biophysique au King's College de Londres et un doctorat en biophysique à l'Institut national de recherche médicale de Mill Hill, Londres en 1973.
Carrière et recherche
Après son doctorat, Thornton travaille en biophysique moléculaire avec David Chilton Phillips à l'Université d'Oxford[8],[9]. En 1978, elle retourne à l'Institut national de recherche médicale, puis obtient une bourse au Birkbeck College, qui fait partie de l'Université de Londres. En 1990, elle est nommée professeur et directrice de l'unité de structure et de modélisation biomoléculaires au département de biochimie et de biologie moléculaire de l'University College de Londres, puis est également nommée à la chaire Bernal du département de cristallographie du Birkbeck College.
Thornton est directrice de l'Institut européen de bioinformatique (EBI) de 2001 à 2015, sur le Wellcome Genome Campus à Hinxton près de Cambridge[10]. Elle est organisatrice de la conférence conjointe sur les systèmes intelligents pour la biologie moléculaire (ISMB) et la Conférence européenne sur la biologie computationnelle (ECCB) à Glasgow en 2004[11].
Le travail de Thornton est hautement interdisciplinaire et s'interface entre autres avec la biologie structurale, la bioinformatique, la chimie biologique et la chimioinformatique. Elle est l'une des pionnières de la validation de structure pour la cristallographie des protéines, en développant le logiciel ProCheck, largement utilisé[12]. Avec Christine Orengo, elle introduit la classification CATH[13] de la structure des protéines[14],[15],[16],[17],[18],[19],[20]. Son groupe développe un outil robuste de classification, de comparaison et d'annotation des enzymes - l'EC-BLAST [21] qui calcule la similarité entre les enzymes sur la base de réactions chimiques en capturant le(s) changement(s) de liaison, le(s) centre(s) de réaction ou la similarité structurelle entre eux[22],[21].
De 2008 à 2012, elle coordonne la phase préparatoire de quatre ans de l'infrastructure européenne de données sur les sciences de la vie ELIXIR[6]. Depuis 2013, elle reste membre du conseil d'administration d'ELIXIR en tant que déléguée scientifique de l'EMBL[23].
↑ a et bCrosswell et Thornton, « ELIXIR: A distributed infrastructure for European biological data », Trends in Biotechnology, vol. 30, no 5, , p. 241–242 (PMID22417641, DOI10.1016/j.tibtech.2012.02.002)
↑(en) David Thomson, « Top scientist tells Bury Grammar School pupils: 'follow your dreams' », Bury Times, (lire en ligne)
↑Thornton et Bayley, « Conformational energy calculations for dinucleotide molecules. A systematic study of dinucleotide conformation, with application to diadenosine pyrophosphate », Biopolymers, vol. 15, no 5, , p. 955–975 (PMID177120, DOI10.1002/bip.1976.360150511, S2CID30211950)
↑Perkins, Piper et Thornton, « Computer techniques for conformational studies of biological molecules », Computers in Biology and Medicine, vol. 6, no 1, , p. 23–31 (PMID1253578, DOI10.1016/0010-4825(76)90034-2)
↑Laskowski, MacArthur, Moss et Thornton, « PROCHECK: A program to check the stereochemical quality of protein structures », Journal of Applied Crystallography, vol. 26, no 2, , p. 283–291 (DOI10.1107/S0021889892009944, Bibcode1993JApCr..26..283L)
↑Orengo, Michie, Jones et Jones, « CATH – a hierarchic classification of protein domain structures », Structure, vol. 5, no 8, , p. 1093–1109 (PMID9309224, DOI10.1016/S0969-2126(97)00260-8)
↑Sibanda, Blundell et Thornton, « Conformation of beta-hairpins in protein structures. A systematic classification with applications to modelling by homology, electron density fitting and protein engineering », Journal of Molecular Biology, vol. 206, no 4, , p. 759–77 (PMID2500530, DOI10.1016/0022-2836(89)90583-4)
↑Thornton, Singh, Campbell et Blundell, « Protein-protein recognition via side-chain interactions », Biochemical Society Transactions, vol. 16, no 6, , p. 927–30 (PMID3224756, DOI10.1042/bst0160927)
↑Reeves, Eilbeck, Magrane et O'Donovan, « The Protein Feature Ontology: A tool for the unification of protein feature annotations », Bioinformatics, vol. 24, no 23, , p. 2767–2772 (PMID18936051, PMCID2912506, DOI10.1093/bioinformatics/btn528)
↑Rahman, Cuesta, Furnham et Holliday, « EC-BLAST: A tool to automatically search and compare enzyme reactions », Nature Methods, vol. 11, no 2, , p. 171–4 (PMID24412978, PMCID4122987, DOI10.1038/nmeth.2803)
