(à partir de la confluence) Cours d'eau Ross, ruisseau des Sauvages, Georges-Bérubé, décharge du Lac à la Truite, ruisseau Hallé, Petite rivière Neigette, ruisseau des Sauvages, décharge du lac des Joncs et du lac Brisson, ruisseau du Lac Noir, ruisseau Dupéré, décharge du Lac Pierre, décharge du Lac à Foin,
La rivière Neigette prend sa source à l'embouchure du Grand Lac Neigette (longueur : 3,6 km ; altitude : 251 m) dans les monts Notre-Dame. Cette source est située à 4,9 km au nord-est de la limite de la municipalité régionale de comté (MRC) de Rimouski-Neigette, à 29,2 km au sud-est du littoral sud-est du fleuve Saint-Laurent et à 11,4 km au sud-ouest du centre du village de Les Hauteurs.
Les principaux affluents du lac sont : la décharge du lac Hudon et du Petit lac Hudon (venant du nord-est), la décharge du Lac Ouellet (venant du sud) et la décharge du Lac à Foin (venant du sud-ouest et se déversant tout près de l'embouchure). Un hameau comportant de chalets a été aménagé sur la rive est du lac.
Cours supérieur de la rivière (segment de 11,2 km)
À partir de l'embouchure du Grand lac Neigette, la rivière Neigette coule sur :
1,6 km vers le nord-ouest, jusqu'à la rive sud du Petit lac Neigette ;
2,9 km vers le nord, en traversant le Petit lac Neigette (longueur : 2,9 km ; altitude : 245 m) sur sa pleine longueur, jusqu'au pont routier, situé à l'embouchure du lac ;
1,9 km vers le nord, jusqu'à la limite de la MRC de Rimouski-Neigette ;
1,6 km vers le nord, jusqu'à la route ;
3,2 km vers le nord, en recueillant les eaux de la décharge du lac à la Truite (venant du sud-ouest), jusqu'à la confluence de la rivière Noire (venant du sud-est).
Cours intermédiaire de la rivière (segment de 15,1 km)
À partir de la confluence de la rivière Noire, la rivière Neigette coule sur :
1,6 km vers le nord, jusqu'à la route de la Rivière-Noire qu'elle coupe à 0,6 km au sud-est du village Le Petit-Saint-Marcellin ;
0,9 km vers le nord, jusqu'à la route 234 qu'elle coupe à 0,5 km au nord-est du village Le Petit-Saint-Marcellin ;
2,0 km vers le nord-ouest, jusqu'à la confluence du ruisseau du lac Noir (venant du sud-ouest) ;
1,3 km vers le nord-ouest, en traversant plusieurs chutes, jusqu'à la confluence de la décharge du Lac des Joncs et du Lac Brisson ;
1,3 km vers le nord-ouest, jusqu'à un pont routier ;
1,1 km vers le nord-ouest, jusqu'à la confluence de la rivière Paquet (venant du nord-est) ;
1,1 km vers le nord-ouest, jusqu'à un pont routier reliant la route du Fourneau-à-Chaux et le secteur est de la rivière Neigette ;
4,6 km vers le nord, en serpentant jusqu'au pont couvert du chemin du 2e rang de Neigette Est ;
0,8 km vers le nord, en serpentant jusqu'à la confluence de la Petite rivière Neigette (venant du sud-ouest) et du ruisseau Hallé (venant du nord-ouest).
Cours inférieur de la rivière (segment de 30,9 km)