À partir de 1978, il se rend plusieurs fois en Albanie dans le cadre des échanges scientifiques entre l’Université de Bonn et l’Académie des sciences d'Albanie. Il participe à plusieurs reprises au Séminaire international sur la langue, la littérature et la culture albanaises à Pristina.
Robert Elsie est l'auteur ou l'éditeur d'une soixantaine de livres et de nombreux articles, principalement dans le domaine de l'albanologie. Il dirige plusieurs sites web sur l'art, la littérature, la langue et l'histoire albanaises. Il a recueilli, entre autres, des échantillons de texte dans les dialectes albanais d'Albanie, d'Italie du Sud, de Grèce, de Croatie, de Bulgarie, de Turquie et d'Ukraine. L'une de ses œuvres les plus importantes est la traduction en anglais de la saga de Gjergj FishtaLahuta e Malcís.
Robert Elsie meurt le à l'âge de 67 ans à Berlin de la maladie de Charcot (maladie du motoneurone). Son cercueil est ensuite exposé dans la Bibliothèque nationale à Tirana, où un service commémoratif en son honneur a eu lieu. Il est honoré par de nombreuses personnalité universitaires, culturelles et politiques albanaises, dont le président Ilir Meta. Il est enterré le à Thethi.
Publications
Dialect relationships in Goidelic – A study in Celtic dialectology. 1986.