Является важным узлом железнодорожных линий на Казань, Екатеринбург, Ижевск и Акбаш. Для приема поездов дальнего следования в восточном и северном направлениях и пригородных (Ижевских) электропоездов используются три платформы с первыми из многочисленных путей, поезда дальнего следования западного направления останавливаются на дальних путях, переход к зданию вокзала по пешеходному путепроводу..
Железнодорожный вокзал станции совмещён с автовокзалом.
Станция и крупные железнодорожные мастерские при ней являются градообразующим предприятием Агрыза, который из небольшого села стал крупным посёлком в связи со строительством Казанбургской железной дороги и основанием на ней данной станции в 1915 году.
Предыдущее небольшое и неотапливаемое здание вокзала на станции было сооружено в 1965 году.
Между двумя остановочными пунктами 3 км и Горочный пост, которые находятся на параллельно идущих в сторону Ижевска линиях, есть отстойник вагонов, где раньше можно было увидеть большое количество «теплушек» и других вагонов довоенной постройки. До начала 1990-х годов в локомотивном депо были 2 маневровых паровоза на ходу.
11 ноября[2]2003 году[3] совместным финансированием Горьковской ЖД и Татарстана на станции было сооружено и открыто новое здание вокзала с подобным дворцу внешним видом, одно из самых крупных и красивых среди вокзалов в Татарстане и Горьковской ЖД, ставшее одной из главных городских достопримечательностей. Стоимость строительства составила 123 млн рублей. Общая вместимость вокзального комплекса площадью 2125 кв. м составила 3600 человек, в том числе в зале ожидания площадью 1052 кв. м на 400 пассажиров. На первом этаже здания действуют также автобусная станция, багажное отделение, камеры хранения, ресторан, кафе и другие сервисы для пассажиров, на втором этаже — комнаты отдыха и гостиница. Стены здания облицованы мрамором и другим природным камнем, черепичная крыша имеет купола и шпили, пол уложен гранитом. На привокзальной площади был обустроен сквер. Вокзал был открыт 11 ноября 2003 с участием президентов Татарстана и Удмуртии М. Ш. Шаймиева и А. А. Волкова и президента ОАО «Российские железные дороги»Г. М. Фадеева.
В 2012 году в связи с открытием транзитного вокзала Казань-2 на станцию Агрыз со вновь сооружённой мощной насосной станцией и высокотехнологичной мусоросборкой были перенесены заправка водой и утилизация мусора пассажирских поездов.