Эскадрилья боевых самолётов (Eskadrila borbenih aviona (EBA)) — 8/4x МиГ-21 бис-Д/УМД, еще использует аэропорта Пула как аэродром переднего базирования
Эскадрилья транспортных самолётов (Eskadrila transportnih aviona (ETA)) — 2x Ан-32, 1x Challenger 604
Авиа-технический батальон (Zrakoplovno-tehnička bojna (ZTB))
Военный объект Лучко (Vojni objekt Lučko, военная часть гражданского аэродрома Нови Загреб - Лучко (Zračno pristanište Lučko)
Авиа-технический батальон (Zrakoplovno-tehnička bojna (ZTB))
Казарма Княз Трпимир (Vojarna „Knez Trpimir“), Аэродром Дивулье (Letjelište Divulje), Трогир, недалеко от города Сплит
Эскадрилья транспортных вертолётов (Eskadrila transportnih helikoptera (ETH)) — 10/2/1x Ми-8МТВ-1/Т/ПС, поддерживает ВМС и Береговую охрану, будет перевооружаться на UH-60 Black Hawk с 2020 года.
Батальон наблюдения воздушного пространства и управления (Bojna zračnog motrenja i navođenja (bZMIN)) — Авиабаза Загреб
Командование батальона (Zapovjedništvo bZMIN)
Центр наблюдения воздушного пространства Подворница (Središte za nadzor zračnog prostora Podvornica (SzNZP Podvornica))
Районный оперативный центр Сплит (Sektorsko operativno središte Split (SOS Split)) (осуществляет оперативную связь с ВМС и Береговой охраной)
5x РЛС FPS-117 в Сльем, Боринци, Папук, Учка и Рота
Рота авиа-технического ремонта и поддержки (Satnija za zrakoplovno-tehničko održavanje i opskrbu (sZTOO))
Учебный центр ВВС и ПВО «Рудольф Перешин» (Središte za obuku Hrvatskog ratnog zrakoplovstva i protuzračne obrane "Rudolf Perešin" (SzO HRZ-a i PZO-a)) — Авиабаза Задар-Земуник
Командование УЦ ВВС и ПВО (Zapovjedništvo SzO-a HRZ-a i PZO-a)
Отдел обучения, доктрины и стандартизации обучения (Odsjek za obuku, doktrinu i standardizaciju obuke)
Отдел поддержки обучения (Odsjek za potporu obuke)
Школа пилотов (Pilotska škola)
Учебный факультет (курсантов) (Odjel za obuku)
Воздухоплавательный отдел (Odsjek zrakoplovstva)
Отдел наблюдения и управления (Odsjek motrenja i navođenja)
Отдел технических служб ВВС и ПВО (Odsjek tehničke službe HRZ-a i PZO-a)
Учебная рота (специалистов) (Satnija za obuku)
Учебный взвод специалистов наблюдения и управления (Vod za obuku vojnika motrenja i navođenja)
Учебный взвод специалистов технических служб ВВС и ПВО (Vod za obuku vojnika tehničke službe HRZ-a i PZO-a)
Ранее принадлежащее ВВС Йемена самолёты перешедшие в собственность украинского государственного предприятия «Одесавиаремсервис», которое отремонтировало и модернизировало их. Куплены у Украины в 2014—2015 годах[5].