Синдекан 1

Синдекан 1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB 4GVC, 4GVD
Идентификаторы
Символ	SDC1 ; CD138; SDC; SYND1; syndecan
Внешние ID	OMIM: 186355 MGI: 1349162 HomoloGene: 2252 GeneCards: Ген SDC1
Генная онтология Функция • glycoprotein binding • protein binding • protein C-terminus binding • cytoskeletal protein binding Компонент клетки • cytoplasm • Golgi lumen • plasma membrane • integral component of plasma membrane • focal adhesion • external side of plasma membrane • lysosomal lumen • protein complex • extracellular vesicular exosome Биологический процесс • retinoid metabolic process • ureteric bud development • carbohydrate metabolic process • glycosaminoglycan biosynthetic process • glycosaminoglycan catabolic process • inflammatory response • phototransduction, visible light • response to toxic substance • extracellular matrix organization • glycosaminoglycan metabolic process • chondroitin sulfate metabolic process • wound healing • lipoprotein metabolic process • odontogenesis • response to hydrogen peroxide • small molecule metabolic process • myoblast development • response to glucocorticoid • response to cAMP • response to calcium ion • striated muscle cell development • Sertoli cell development • canonical Wnt signaling pathway Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид	Человек	Мышь
Entrez	6382	20969
Ensembl	ENSG00000115884	ENSMUSG00000020592
UniProt	P18827	P18828
RefSeq (мРНК)	NM_001006946	NM_011519
RefSeq (белок)	NP_001006947	NP_035649
Локус (UCSC)	Chr 2: 20.4 – 20.43 Mb	Chr 12: 8.77 – 8.79 Mb
Поиск в PubMed	Искать	Искать

Синдекан 1 (англ. syndecan 1; CD138) — мембранный белок, протеогликан семейства синдеканов, или трансмембранных гепарансульфатпротеогликанов. Всего описано 4 белка этого семейства. Продукт гена человека SDC1.

Белок является трансмембранным гепарансульфатпротеогликаном, входит в семейство синдеканов. Синдеканы опосредуют связывание клеток, передачу сигнала в клетке и организацию цитоскелета. Являются рецепторами для Tat-белка вируса ВИЧ. Синдекан 1 участвует в клеточной пролиферации, клеточной миграции и клеточном взаимодействии с белками внеклеточного матрикса.^[1]

Синдекан 1 несёт гепарансульфатные и хондроитинсульфатные цепи, которые обеспечивают связь цитоскелета с внеклеточным матриксом. Связывается с CDCP1.

Отщепление эктодомена приводит к образованию растворимой формы белка. Отщепление может происходить под действием гепараназы, тромбина и эпидермального фактора роста, а также при стрессе и в процессе заживления раны.

Белок состоит из 288 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 32.5 кДа. Включает N-концевой внеклеточный домен (232 аминокислоты), единственный спиральный трансмембранный фрагмент и небольшой цитозольный участок. На внеклеточном домене находится 6 участков гликозилирования: 3 участка присоединения O-хондроитинсульфатных цепей, 2 участка присоединения O-гепарансульфатных цепей и 1 участок N-гликозилирования. Цитозольный фрагмент содержит фосфорилируемый тирозин.

Синдекан 1 используется в качестве маркёра плазматических клеток^[2], если известно, что клетки произошли из клеток крови.^[3]

• Синдеканы
• Синдекан 2

• Teng Y.H., Aquino R.S., Park P.W. Molecular functions of syndecan-1 in disease (англ.) // Matrix Biol.^[англ.] : journal. — 2012. — January (vol. 31, no. 1). — P. 3—16. — doi:10.1016/j.matbio.2011.10.001. — PMID 22033227.
• Katz B.Z. Adhesion molecules--The lifelines of multiple myeloma cells (англ.) // Semin. Cancer Biol. : journal. — 2010. — June (vol. 20, no. 3). — P. 186—195. — doi:10.1016/j.semcancer.2010.04.003. — PMID 20416379.
• Bass M.D., Morgan M.R., Humphries M.J. Syndecans shed their reputation as inert molecules (англ.) // Sci Signal^[англ.] : journal. — 2009. — March (vol. 2, no. 64). — P. pe18. — doi:10.1126/scisignal.264pe18. — PMID 19336838. — PMC 3328204.

• Клеточный матрикс. Синдекан.